我正在使用一个大型数据集，其中每个文件（在线存储）都有一个类似于
import datetime
def fname(dt: datetime.datetime):
return "dataset-" + dt.strftime("%Y%m%d-%H%M%S") + ".gz"
def url(dt: datetime.datetime):
return "url.com/" + fname(dt)在我的 Snakefile 中，我有一个我想要使用的日期时间列表。对于每个我需要从互联网上下载相应的文件（使用 wget 或类似的）。
rule download:
output: # would like to specify `fname(dt)`
shell: # would like to `wget -O url(dt)`做这样的事情的正确方法是什么？
回答1
我认为最直接的方法是创建一个元数据table，每行代表文件名和下载URL，并使用它根据文件名查询rule download中的下载URL
或者您可以在 rule all 中指定所有文件：
rule all:
input:
[fname(dt) for dt in dts]然后 rule download：
rule download:
output: "{file}"
shell: "wget -O url.com/{output}"